历时半年的“NGS BRCA校准计划”结果出台！该项目由中国医疗器械行业协会主办，阿斯利康投资（中国）有限公司、默沙东（中国）投资有限公司、赛默飞世尔科技（中国）有限公司、illumina中国等共同支持，是为了规范以高通量测序技术为平台的BRCA检测，更好地指导临床实践，并进一步加强临床、病理及测序技术专家之间的交流。项目完成了中国首次BRCA检测状况的大型调研、变异解读及标准品测试，这是首次对国内BRCA检测的实际情况进行了全面的了解。
项目专家委员会秘书长、北京协和医院吴焕文副教授对项目进行了总结。自项目启动以来，共有超过60家检测公司参与问卷调研，其中41家检测公司参与了变异解读能力测试，28家参与胚系BRCA（gBRCA）检测能力测试，20家参与肿瘤组织BRCA（tBRCA）检测能力测试。
拓普基因参与了这三项测评，并且全部通过。
BRCA检测的重要意义
BRCA1/2基因是抑癌基因，是同源重组修复通路上的关键基因，BRCA1/2基因突变导致抑癌功能丧失或减弱，主要造成蛋白截短，介导同源重组功能丧失，损伤修复能力下降，累积基因组不稳定性，可以显著增加患乳腺癌、卵巢癌和其他多种肿瘤患癌风险。
BRCA基因突变在我国的突变率分布数据
中国女性乳腺癌患者总BRCA1/2突变率约为5%-10%；解云涛课题组的5931例大样本的乳腺癌研究显示，BRCA突变率分布情况：家族性乳腺癌患者16.9 %；早发性乳腺癌患者(≤40岁)5.2 %；三阴性乳腺癌患者（≤50岁)10.6%。
中国女性卵巢癌患者的BRCA突变率情况：由拓普基因开展的中国人群BRCA大数据研究，并在2018年发表在妇科肿瘤杂志上。本研究是至今中国人群最大样本量的卵巢癌BRCA基因检测研究。研究入组了1331例卵巢癌患者，另外1763例健康人做对照。研究结果显示研究结果显示，健康人中有0.45%的BRCA突变率。卵巢癌患者中BRCA突变率约为21.64%。
携带BRCA1/2突变可能带来的风险
携带BRCA1/2突变终身乳腺癌/卵巢癌患病风险明显增高
发表在JAMA杂志上的BRCA1/2累积发病率最新数据：至80岁时乳腺癌累积风险：72%（BRCA1），69% (BRCA2)；至80岁时卵巢癌累积风险：44% (BRCA1)，17%(BRCA2)。
携带BRCA1/2第二原发乳腺癌风险明显增高
携带BRCA1/2一二级亲属均有50%几率携带
BRCA突变携带者的建议
对于未患乳腺癌的基因携带者在医生指导下进行定期筛查/手术预防/药物预防。
对于对于已患乳腺癌的基因携带者指导下进行定期筛查、手术预防/药物预防降低第二原发癌，而且携带BRCA1/2突变的乳腺癌对铂类和PARP抑制剂敏感（其中奥拉帕利已在国内上市）。
癌种 FDA获批药物
乳腺癌 奥拉帕利、talazoparib
卵巢癌 奥拉帕利、Rucaparib、尼拉帕尼
BRCA的规范检测
BRCA检测困难点
无论是 BRCA1 还是 BRCA2 基因，都无明显的热点突变，整个致病和可能致病突变覆盖整个编码区。外显子长度和突变个数成正比，外显子越长，发生的突变数目也越多；在蛋白结构域之间，发生的突变数目无显著性差异；突变类型也多种多样，包括点突变、插入缺失、大片段重排等特点，造成了BRCA检测存在一定的困难。
BRCA数据解读困难点根据ACMG发布胚系变异分类指南，将BRCA基因变异按照风险程度由高至低分为以下５类：致病性（５类，致病可能性＞0.99）、可能致病性（４ 类，致病可能性在 0.95～0.99之间）、意义未明（３类，致病可能性在0.05～0.94之间）、可能良性（２类，致病可能性在0.001～0.049之间） 和良性（１ 类，致病可能性＜0.001）。
其中VUS突变是最难以取舍的突变类型，基于目前拓普基因已有数据积累，正在开发VUS重分类预测系统，来预测VUS的致病性的概率，帮助VUS的判读。
近两年来，为了规范BRCA的检测和数据解读等，陆陆续续发表了多个专家共识：《BRCA数据解读中国专家共识》、《中国乳腺癌患者BRCA1/2基因检测与临床应用专家共识（2018年版）》、《基于下一代测序技术的BRCA基因检测流程中国专家共识》。基于这些共识，拓普基因建立了自身的对BRCA检测和数据解读的严格标准。下图为拓普基因整个实验流程：
国家目前对NGS实验室尚未出台统一的建设规范，但拓普基因在通过国际的实验室资质认证来进行自我检测质量的提升，并定期参加国际和国内BRCA室间质评项目。拓普基因连续两年参加EMQN，并且顺利通过。
另外，拓普基因还参加了阿斯利康与EMQN联合举办的关于卵巢癌患者中BRCA胚系突变和体系突变的室间质评，并且顺利通过。
拓普基因BRCA相关项目有两个：
关于BRCA基因在相关癌症中的临床研究和数据库工作，拓普基因一直在努力为行业奉献自己的一份力量！